Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms