Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms