Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SDSP20132 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SDSP20132 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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