Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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