Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms