Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLA1P09884 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLA1P09884 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLA1P09884 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms