Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CLDN9O95484 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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