Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms