Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf172C9J069 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms