Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms