Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms