Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms