Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms