Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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CTXN3Q4LDR2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN3Q4LDR2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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