Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NRF1Q16656 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms