Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NBR1Q14596 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms