Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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TCOF1Q13428 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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TCOF1Q13428 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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TCOF1Q13428 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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TCOF1Q13428 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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TCOF1Q13428 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCOF1Q13428 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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