Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms