Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSCP56915 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms