Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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