Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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