Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms