Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms