Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms