Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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