Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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