Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms