Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LTAP01374 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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LTAP01374 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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LTAP01374 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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LTAP01374 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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LTAP01374 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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LTAP01374 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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LTAP01374 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LTAP01374 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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