Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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