Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms