Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms