Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM17Q9Y577 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRIM17Q9Y577 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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