Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms