Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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