Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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