Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms