Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms