Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms