Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms