Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms