Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms