Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6P435 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6P435 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6P435 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6P435 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6P435 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6P435 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6P435 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6P435 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6P435 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6P435 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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