Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms