Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PKDCCQ504Y2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms