Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms