Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CACNA1DQ01668 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms