Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms