Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms