Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms