Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms